| 中文名 | 学名 | 保护级别 | 备注 | |
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裸子植物 Gymnosperms |
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| 苏铁科 | Cycadaceae | |||
| 苏铁属（所有种） | Cycas spp. | 一级 | ||
| 银杏科 | Ginkgoaceae | |||
| 银杏 | Ginkgo biloba | 一级 | ||
| 罗汉松科 | Podocarpaceae | |||
| 罗汉松属（所有种） | Podocarpus spp. | 二级 | ||
| 柏科 | Cupressaceae | |||
| 翠柏 | Calocedrus macrolepis | 二级 | ||
| 岩生翠柏 | Calocedrus rupestris | 二级 | ||
| 红桧 | Chamaecyparis formosensis | 二级 | ||
| 岷江柏木 | Cupressus chengiana | 二级 | ||
| 巨柏 | Cupressus gigantea | 一级 | ||
| 西藏柏木 | Cupressus torulosa | 一级 | ||
| 福建柏 | Fokienia hodginsii | 二级 | ||
| 水松 | Glyptostrobus pensilis | 一级 | ||
| 水杉 | Metasequoia glyptostroboides | 一级 | ||
| 台湾杉（秃杉） | Taiwania cryptomerioides | 二级 | 包括 Taiwania flousiana | |
| 朝鲜崖柏 | Thuja koraiensis | 二级 | ||
| 崖柏 | Thuja sutchuenensis | 一级 | ||
| 越南黄金柏 | Xanthocyparis vietnamensis | 二级 | ||
| 红豆杉科 | Taxaceae | |||
| 穗花杉属（所有种） | Amentotaxus spp. | 二级 | ||
| 海南粗榧 | Cephalotaxus hainanensis | 二级 | ||
| 贡山三尖杉 | Cephalotaxus lanceolata | 二级 | ||
| 篦子三尖杉 | Cephalotaxus oliveri | 二级 | ||
| 白豆杉 | Pseudotaxus chienii | 二级 | ||
| 红豆杉属（所有种） | Taxus spp. | 一级 | ||
| 榧树属（所有种） | Torreya spp. | 二级 | ||
| 松科 | Pinaceae | |||
| 百山祖冷杉 | Abies beshanzuensis | 一级 | ||
| 资源冷杉 | Abies beshanzuensis var. ziyuanensis | 一级 | ||
| 秦岭冷杉 | Abies chensiensis | 二级 | ||
| 梵净山冷杉 | Abies fanjingshanensis | 一级 | ||
| 元宝山冷杉 | Abies yuanbaoshanensis | 一级 | ||
| 银杉 | Cathaya argyrophylla | 一级 | ||
| 油杉属（所有种，铁坚油杉、云南油杉、油杉除外） | Keteleeria spp. (excl. K. davidiana var.
davidiana, K. evelyniana & K. fortunei ) |
二级 | ||
| 大果青扦 | Picea neoveitchii | 二级 | ||
| 大别山五针松 | Pinus dabeshanensis | 一级 | 其他常用学名：Pinus armandii
var. dabeshanensis, Pinus fenzeliana var. dabeshanensis |
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| 兴凯赤松 | Pinus densiflora var. ussuriensis | 二级 | ||
| 红松 | Pinus koraiensis | 二级 | ||
| 华南五针松 | Pinus kwangtungensis | 二级 | ||
| 雅加松 | Pinus massoniana var. hainanensis | 二级 | ||
| 巧家五针松 | Pinus squamata | 一级 | ||
| 长白松 | Pinus sylvestris var. sylvestriformis | 二级 | ||
| 毛枝五针松 | Pinus wangii | 一级 | ||
| 金钱松 | Pseudolarix amabilis | 二级 | ||
| 黄杉属（所有种） | Pseudotsuga spp. | 二级 | ||
| 麻黄科 | Ephedraceae | |||
| 斑子麻黄 | Ephedra rhytidosperma | 二级 | ||
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