| 中文名 | 学名 | 保护级别 | 备注 | |
| 被子植物 Angiosperms | ||||
| 莼菜科 | Cabombaceae | |||
| 莼菜* | Brasenia schreberi | 二级 | ||
| 睡莲科 | Nymphaeaceae | |||
| 雪白睡莲* | Nymphaea candida | 二级 | ||
| 五味子科 | Schisandraceae | |||
| 地枫皮 | Illicium difengpi | 二级 | 属的系统学位置发生变动 | |
| 大果五味子 | Schisandra macrocarpa | 二级 | ||
| 马兜铃科 | Aristolochiaceae | |||
| 囊花马兜铃 | Aristolochia utriformis | 二级 | ||
| 金耳环 | Asarum insigne | 二级 | ||
| 马蹄香 | Saruma henryi | 二级 | ||
| 肉豆蔻科 | Myristicaceae | |||
| 风吹楠属（所有种） | Horsfieldia spp. | 二级 | ||
| 云南肉豆蔻 | Myristica yunnanensis | 二级 | ||
| 木兰科 | Magnoliaceae | |||
| 长蕊木兰 | Alcimandra cathcartii | 二级 | ||
| 厚朴 | Houpoëa officinalis | 二级 | 包括种下等级，凹叶厚朴并入本
种。 |
|
| 长喙厚朴 | Houpoëa rostrata | 二级 | 其他常用学名：Magnolia rostrata | |
| 大叶木兰 | Lirianthe henryi | 二级 | 其他常用学名：Magnolia henryi | |
| 馨香玉兰（馨香木兰） | Lirianthe odoratissima | 二级 | 其他常用学名：Magnolia
odoratissima |
|
| 鹅掌楸（马褂木） | Liriodendron chinense | 二级 | ||
| 香木莲 | Manglietia aromatica | 二级 | ||
| 大叶木莲 | Manglietia dandyi | 二级 | ||
| 落叶木莲 | Manglietia decidua | 二级 | ||
| 大果木莲 | Manglietia grandis | 二级 | ||
| 厚叶木莲 | Manglietia pachyphylla | 二级 | ||
| 毛果木莲 | Manglietia ventii | 二级 | ||
| 香子含笑（香籽含笑） | Michelia hypolampra | 二级 | ||
| 广东含笑 | Michelia guangdongensis | 二级 | ||
| 石碌含笑 | Michelia shiluensis | 二级 | ||
| 峨眉含笑 | Michelia wilsonii | 二级 | ||
| 圆叶天女花（圆叶玉兰） | Oyama sinensis | 二级 | 其他常用学名: Magnolia sinensis | |
| 西康天女花（西康玉兰） | Oyama wilsonii | 二级 | 其他常用学名: Magnolia wilsonii | |
| 华盖木 | Pachylarnax sinica | 一级 | ||
| 峨眉拟单性木兰 | Parakmeria omeiensis | 一级 | ||
| 云南拟单性木兰 | Parakmeria yunnanensis | 二级 | ||
| 合果木 | Paramichelia baillonii | 二级 | 其他常用学名: Michelia baillonii | |
| 焕镛木（单性木兰） | Woonyoungia septentrionalis | 一级 | ||
| 宝华玉兰 | Yulania zenii | 二级 | 其他常用学名：Magnolia zenii | |
| 番荔枝科 | Annonaceae | |||
| 蕉木 | Chieniodendron hainanense | 二级 | 其他常用学名：Meiogyne
hainanensis |
|
| 文采木 | Wangia saccopetaloides | 二级 | 其他常用中文名：囊瓣亮花木、亮
花假鹰爪 |
|
| 蜡梅科 | Calycanthaceae | |||
| 夏蜡梅 | Calycanthus chinensis | 二级 | ||
| 莲叶桐科 | Hernandiaceae | |||
| 莲叶桐 | Hernandia nymphaeifolia | 二级 | ||
| 樟科 | Lauraceae | |||
| 油丹 | Alseodaphne hainanensis | 二级 | ||
| 皱皮油丹 | Alseodaphne rugosa | 二级 | ||
| 茶果樟 | Cinnamomum chago | 二级 | ||
| 天竺桂 | Cinnamomum japonicum | 二级 | 其他常用中文名：普陀樟 | |
| 油樟 | Cinnamomum longepaniculatum | 二级 | ||
| 卵叶桂 | Cinnamomum rigidissimum | 二级 | ||
| 润楠 | Machilus nanmu | 二级 | ||
| 舟山新木姜子 | Neolitsea sericea | 二级 | ||
| 闽楠 | Phoebe bournei | 二级 | ||
| 浙江楠 | Phoebe chekiangensis | 二级 | ||
| 细叶楠 | Phoebe hui | 二级 | ||
| 楠木 | Phoebe zhennan | 二级 | ||
| 孔药楠 | Sinopora hongkongensis | 二级 | 其他常用学名：Syndiclis
hongkongensis |
|
| 泽泻科 | Alismataceae | |||
| 拟花蔺* | Butomopsis latifolia | 二级 | ||
| 长喙毛茛泽泻* | Ranalisma rostrata | 二级 | ||
| 浮叶慈菇* | Sagittaria natans | 二级 | ||
| 水鳖科 | Hydrocharitaceae | |||
| 高雄茨藻* | Najas browniana | 二级 | ||
| 海菜花属（所有种）* | Ottelia spp. | 二级 | 其他常用中文名：水车前属 | |
| 冰沼草科 | Scheuchzeriaceae | |||
| 冰沼草* | Scheuchzeria palustris | 二级 | ||
| 翡若翠科 | Velloziaceae | |||
| 芒苞草 | Acanthochlamys bracteata | 二级 | ||
| 藜芦科 | Melanthiaceae | |||
| 重楼属（所有种，北重楼除外）* | Paris spp. (excl. P. verticillata ) | 二级 | ||
| 百合科 | Liliaceae | |||
| 荞麦叶大百合* | Cardiocrinum cathayanum | 二级 | ||
| 贝母属（所有种）* | Fritillaria spp. | 二级 | ||
| 秀丽百合* | Lilium amabile | 二级 | ||
| 绿花百合* | Lilium fargesii | 二级 | ||
| 乳头百合* | Lilium papilliferum | 二级 | ||
| 天山百合* | Lilium tianschanicum | 二级 | ||
| 青岛百合* | Lilium tsingtauense | 二级 | ||
| 郁金香属（所有种）* | Tulipa spp. | 二级 | ||
| 兰科 | Orchidaceae | |||
| 香花指甲兰 | Aerides odorata | 二级 | ||
| 金线兰属（所有种）* | Anoectochilus spp. | 二级 | 其他常用中文名：开唇兰属 | |
| 白及* | Bletilla striata | 二级 | ||
| 美花卷瓣兰 | Bulbophyllum rothschildianum | 二级 | ||
| 独龙虾脊兰 | Calanthe dulongensis | 二级 | ||
| 大黄花虾脊兰 | Calanthe striata var. sieboldii | 一级 | 其他常用学名： Calanthe sieboldii | |
| 独花兰 | Changnienia amoena | 二级 | ||
| 大理铠兰 | Corybas taliensis | 二级 | ||
| 杜鹃兰 | Cremastra appendiculata | 二级 | ||
| 兰属（所有种，被列入一级保护的美花兰和文山红柱兰除外。兔耳兰未列入名录） |
Cymbidium spp. (excl. C. insigne, C. wenshanense , C. lancifolium ) |
二级 |
||
| 美花兰 | Cymbidium insigne | 一级 | ||
| 文山红柱兰 | Cymbidium wenshanense | 一级 | ||
| 杓兰属（所有种，被列入一级保护的暖地杓兰除外。离萼杓兰未
列入名录） |
Cypripedium spp. (excl. C. subtropicum, C. plectrochilum ) |
二级 |
||
| 暖地杓兰 | Cypripedium subtropicum | 一级 | 包括Cypripedium singchii | |
| 丹霞兰属（所有种） | Danxiaorchis spp. | 二级 | ||
| 石斛属（所有种，被列入一级保
护的曲茎石斛和霍山石斛除外）* |
Dendrobium spp. (excl. D. flexicaule, D. huoshanense ) | 二级 | ||
| 曲茎石斛* | Dendrobium flexicaule | 一级 | ||
| 霍山石斛* | Dendrobium huoshanense | 一级 | ||
| 原天麻* | Gastrodia angusta | 二级 | ||
| 天麻* | Gastrodia elata | 二级 | ||
| 手参* | Gymnadenia conopsea | 二级 | ||
| 西南手参* | Gymnadenia orchidis | 二级 | ||
| 血叶兰 | Ludisia discolor | 二级 | ||
| 兜兰属（所有种，被列入二级保
护的带叶兜兰和硬叶兜兰除外） |
Paphiopedilum spp. (excl. P. hirsutissimum,
P. micranthum) |
一级 | ||
| 带叶兜兰 | Paphiopedilum hirsutissimum | 二级 | ||
| 硬叶兜兰 | Paphiopedilum micranthum | 二级 | ||
| 海南鹤顶兰 | Phaius hainanensis | 二级 | ||
| 文山鹤顶兰 | Phaius wenshanensis | 二级 | ||
| 罗氏蝴蝶兰 | Phalaenopsis lobbii | 二级 | ||
| 麻栗坡蝴蝶兰 | Phalaenopsis malipoensis | 二级 | ||
| 华西蝴蝶兰 | Phalaenopsis wilsonii | 二级 | ||
| 象鼻兰 | Phalaenopsis zhejiangensis | 一级 | ||
| 独蒜兰属（所有种） | Pleione spp. | 二级 | ||
| 火焰兰属（所有种） | Renanthera spp. | 二级 | ||
| 钻喙兰 | Rhynchostylis retusa | 二级 | ||
| 大花万代兰 | Vanda coerulea | 二级 | ||
| 深圳香荚兰 | Vanilla shenzhenica | 二级 | ||
| 鸢尾科 | Iridaceae | |||
| 水仙花鸢尾* | Iris narcissiflora | 二级 | ||
| 天门冬科 | Asparagaceae | |||
| 海南龙血树 | Dracaena cambodiana | 二级 | 其他常用中文名：柬埔寨龙血树 | |
| 剑叶龙血树 | Dracaena cochinchinensis | 二级 | ||
| 兰花蕉科 | Lowiaceae | |||
| 海南兰花蕉 | Orchidantha insularis | 二级 | ||
| 云南兰花蕉 | Orchidantha yunnanensis | 二级 | ||
| 姜科 | Zingiberaceae | |||
| 海南豆蔻* | Amomum hainanense | 二级 | ||
| 宽丝豆蔻* |
Amomum petaloideum |
二级 | 其他常用中文名：拟豆蔻；其他常用学名：Paramomum
petaloideum |
|
| 细莪术* | Curcuma exigua | 二级 | ||
| 茴香砂仁 | Etlingera yunnanensis | 二级 | ||
| 长果姜 | Siliquamomum tonkinense | 二级 | ||
| 棕榈科 | Arecaceae | |||
| 董棕 | Caryota obtusa | 二级 | ||
| 琼棕 | Chuniophoenix hainanensis | 二级 | ||
| 矮琼棕 | Chuniophoenix humilis | 二级 | ||
| 水椰* | Nypa fruticans | 二级 | ||
| 小钩叶藤 | Plectocomia microstachys | 二级 | ||
| 龙棕 | Trachycarpus nanus | 二级 | ||
| 香蒲科 | Typhaceae | |||
| 无柱黑三棱* | Sparganium hyperboreum | 二级 | 其他常用中文名: 北方黑三棱 | |
| 禾本科 | Poaceae | |||
| 短芒芨芨草* | Achnatherum breviaristatum | 二级 | ||
| 沙芦草 | Agropyron mongolicum | 二级 | ||
| 三刺草 | Aristida triseta | 二级 | ||
| 山涧草 | Chikusichloa aquatica | 二级 | ||
| 流苏香竹 | Chimonocalamus fimbriatus | 二级 | ||
| 莎禾 | Coleanthus subtilis | 二级 | ||
| 阿拉善披碱草* | Elymus alashanicus | 二级 | ||
| 黑紫披碱草* | Elymus atratus | 二级 | ||
| 短柄披碱草* | Elymus brevipes | 二级 | ||
| 内蒙披碱草* | Elymus intramongolicus | 二级 | ||
| 紫芒披碱草* | Elymus purpuraristatus | 二级 | ||
| 新疆披碱草* | Elymus sinkiangensis | 二级 | ||
| 无芒披碱草 | Elymus sinosubmuticus | 二级 | ||
| 毛披碱草 | Elymus villifer | 二级 | ||
| 铁竹 | Ferrocalamus strictus | 一级 | ||
| 贡山竹 | Gaoligongshania megalothyrsa | 二级 | ||
| 内蒙古大麦 | Hordeum innermongolicum | 二级 | ||
| 纪如竹 | Hsuehochloa calcarea | 二级 | ||
| 水禾* | Hygroryza aristata | 二级 | ||
| 青海以礼草 | Kengyilia kokonorica | 二级 | ||
| 青海固沙草* | Orinus kokonorica | 二级 | ||
| 稻属（所有种）* | Oryza spp. | 二级 | ||
| 华山新麦草 | Psathyrostachys huashanica | 一级 | ||
| 三蕊草 | Sinochasea trigyna | 二级 | ||
| 拟高梁* | Sorghum propinquum | 二级 | ||
| 箭叶大油芒 | Spodiopogon sagittifolius | 二级 | ||
| 中华结缕草* | Zoysia sinica | 二级 | ||
| 罂粟科 | Papaveraceae | |||
| 石生黄堇 | Corydalis saxicola | 二级 | 其他常用中文名：岩黄连 | |
| 久治绿绒蒿 | Meconopsis barbiseta | 二级 | ||
| 红花绿绒蒿 | Meconopsis punicea | 二级 | ||
| 毛瓣绿绒蒿 | Meconopsis torquata | 二级 | ||
| 防己科 | Menispermaceae | |||
| 古山龙 | Arcangelisia gusanlung | 二级 | ||
| 藤枣 | Eleutharrhena macrocarpa | 二级 | ||
| 小檗科 | Berberidaceae | |||
| 八角莲属（所有种） | Dysosma spp. | 二级 | 其他常用中文名：鬼臼属 | |
| 小叶十大功劳 | Mahonia microphylla | 二级 | ||
| 靖西十大功劳 | Mahonia subimbricata | 二级 | ||
| 桃儿七 | Sinopodophyllum hexandrum | 二级 | ||
| 星叶草科 | Circaeasteraceae | |||
| 独叶草 | Kingdonia uniflora | 二级 | ||
| 毛茛科 | Ranunculaceae | |||
| 北京水毛茛* | Batrachium pekinense | 二级 | ||
| 槭叶铁线莲* | Clematis acerifolia | 二级 | 含种下等级 | |
| 黄连属（所有种）* | Coptis spp. | 二级 | ||
| 莲科 | Nelumbonaceae | |||
| 莲* | Nelumbo nucifera | 二级 | ||
| 昆栏树科 | Trochodendraceae | |||
| 水青树 | Tetracentron sinense | 二级 | ||
| 芍药科 | Paeoniaceae | |||
| 芍药属牡丹组（所有种，被列入一级保护的卵叶牡丹和紫斑牡丹
除外，牡丹未列入名录）* |
Paeonia sect. Moutan spp. (excl. P. qiui, P. rockii & P. suffruticosa ) | 二级 |
牡丹为栽培物种，不列入保护植物 |
|
| 卵叶牡丹* | Paeonia qiui | 一级 | ||
| 紫斑牡丹* | Paeonia rockii | 一级 | ||
| 白花芍药* | Paeonia sterniana | 二级 | ||
| 阿丁枫科 | Altingiaceae | |||
| 赤水蕈树 | Altingia multinervis | 二级 | ||
| 金缕梅科 | Hamamelidaceae | |||
| 山铜材 | Chunia bucklandioides | 二级 | ||
| 长柄双花木 | Disanthus cercidifolius subsp. longipes | 二级 | ||
| 四药门花 | Loropetalum subcordatum | 二级 | ||
| 银缕梅 | Parrotia subaequalis | 一级 | ||
| 连香树科 | Cercidiphyllaceae | |||
| 连香树 | Cercidiphyllum japonicum | 二级 | ||
| 景天科 | Crassulaceae | |||
| 长白红景天 | Rhodiola angusta | 二级 | ||
| 大花红景天 | Rhodiola crenulata | 二级 | ||
| 长鞭红景天 | Rhodiola fastigiata | 二级 | ||
| 喜马红景天 | Rhodiola himalensis | 二级 | 其他常用中文名：喜马拉雅红景天 | |
| 四裂红景天 | Rhodiola quadrifida | 二级 | ||
| 红景天 | Rhodiola rosea | 二级 | ||
| 库页红景天 | Rhodiola sachalinensis | 二级 | ||
| 圣地红景天 | Rhodiola sacra | 二级 | ||
| 唐古红景天 | Rhodiola tangutica | 二级 | ||
| 粗茎红景天 | Rhodiola wallichiana | 二级 | ||
| 云南红景天 | Rhodiola yunnanensis | 二级 | ||
| 小二仙草科 | Haloragaceae | |||
| 乌苏里狐尾藻* | Myriophyllum ussuriense | 二级 | ||
| 锁阳科 | Cynomoriaceae | |||
| 锁阳* | Cynomorium songaricum | 二级 | 其他常用学名: Cynomorium
coccineum subsp. songaricum |
|
| 葡萄科 | Vitaceae | |||
| 百花山葡萄 | Vitis baihuashanensis | 一级 | ||
| 浙江蘡薁 | Vitis zhejiang-adstricta | 二级 | ||
| 蒺藜科 | Zygophyllaceae | |||
| 四合木 | Tetraena mongolica | 二级 | ||
| 豆科 | Fabaceae | |||
| 沙冬青 | Ammopiptanthus mongolicus | 二级 | ||
| 棋子豆 | Archidendron robinsonii | 二级 | ||
| 紫荆叶羊蹄甲 | Bauhinia cercidifolia | 二级 | ||
| 丽豆* | Calophaca sinica | 二级 | ||
| 黑黄檀 | Dalbergia cultrata | 二级 | ||
| 海南黄檀 | Dalbergia hainanensis | 二级 | ||
| 降香 | Dalbergia odorifera | 二级 | 其他常用中文名: 降香黄檀 | |
| 卵叶黄檀 | Dalbergia ovata | 二级 | ||
| 格木 | Erythrophleum fordii | 二级 | ||
| 山豆根* | Euchresta japonica | 二级 | ||
| 绒毛皂荚 | Gleditsia japonica var. velutina | 一级 | ||
| 野大豆* | Glycine soja | 二级 | 其他常用学名: Glycine max subsp.
soja |
|
| 烟豆* | Glycine tabacina | 二级 | ||
| 短绒野大豆* | Glycine tomentella | 二级 | ||
| 胀果甘草 | Glycyrrhiza inflata | 二级 | ||
| 甘草 | Glycyrrhiza uralensis | 二级 | 其他常用中文名：乌拉尔甘草 | |
| 浙江马鞍树 | Maackia chekiangensis | 二级 | ||
| 红豆属(所有种，被列入一级保护
的小叶红豆除外。） |
Ormosia spp. (excl. O. microphylla ) | 二级 | ||
| 小叶红豆 | Ormosia microphylla | 一级 | ||
| 冬麻豆属(所有种） | Salweenia spp. | 二级 | ||
| 油楠 | Sindora glabra | 二级 | ||
| 越南槐 | Sophora tonkinensis | 二级 | 其他常用中文名: 广豆根 | |
| 海人树科 | Surianaceae | |||
| 海人树 | Suriana maritima | 二级 | ||
| 蔷薇科 | Rosaceae | |||
| 太行花 | Geum rupestre | 二级 | 其他常用学名: Taihangia rupestris | |
| 山楂海棠* | Malus komarovii | 二级 | ||
| 丽江山荆子* | Malus rockii | 二级 | ||
| 新疆野苹果* | Malus sieversii | 二级 | ||
| 锡金海棠* | Malus sikkimensis | 二级 | ||
| 绵刺* | Potaninia mongolica | 二级 | ||
| 新疆野杏* | Prunus armeniaca | 二级 | 其他常用学名: Armeniaca vulgaris | |
| 新疆樱桃李* | Prunus cerasifera | 二级 | 其他常用中文名: 樱桃李 | |
| 甘肃桃* | Prunus kansuensis | 二级 | 其他常用学名: Amygdalus
kansuensis |
|
| 蒙古扁桃* | Prunus mongolica | 二级 | 其他常用学名: Amygdalus
mongolica |
|
| 光核桃* | Prunus mira | 二级 | 其他常用学名: Amygdalus mira | |
| 矮扁桃（野巴旦，野扁桃）* | Prunus nana | 二级 | 其他常用学名: Amygdalus nana | |
| 政和杏* | Prunus zhengheensis | 二级 | 其他常用学名: Armeniaca
zhengheensis |
|
| 银粉蔷薇 | Rosa anemoniflora | 二级 | ||
| 小檗叶蔷薇 | Rosa berberifolia | 二级 | ||
| 单瓣月季花 | Rosa chinensis var. spontanea | 二级 | ||
| 广东蔷薇 | Rosa kwangtungensis | 二级 | ||
| 亮叶月季 | Rosa lucidissima | 二级 | ||
| 大花香水月季 | Rosa odorata var. gigantea | 二级 | ||
| 中甸刺玫 | Rosa praelucens | 二级 | ||
| 玫瑰 | Rosa rugosa | 二级 | ||
| 胡颓子科 | Elaeagnaceae | |||
| 翅果油树 | Elaeagnus mollis | 二级 | ||
| 鼠李科 | Rhamnaceae | |||
| 小勾儿茶 | Berchemiella wilsonii | 二级 | ||
| 榆科 | Ulmaceae | |||
| 长序榆 | Ulmus elongata | 二级 | ||
| 大叶榉树 | Zelkova schneideriana | 二级 | ||
| 桑科 | Moraceae | |||
| 南川木波罗 | Artocarpus nanchuanensis | 二级 | ||
| 奶桑 | Morus macroura | 二级 | ||
| 川桑* | Morus notabilis | 二级 | ||
| 长穗桑* | Morus wittiorum | 二级 | ||
| 荨麻科 | Urticaceae | |||
| 光叶苎麻* | Boehmeria leiophylla | 二级 | Flora of China将本种处理为腋球苎
麻Boehmeria glomerulifera |
|
| 长圆苎麻* | Boehmeria oblongifolia | 二级 | Flora of China将本种处理为腋球苎
麻Boehmeria glomerulifera |
|
| 壳斗科 | Fagaceae | |||
| 华南锥 | Castanopsis concinna | 二级 | 其他常用中文名：华南栲 | |
| 西畴青冈 | Cyclobalanopsis sichourensis | 二级 | 其他常用学名：Quercus
sichourensis |
|
| 台湾水青冈 | Fagus hayatae | 二级 | ||
| 三棱栎 | Formanodendron doichangensis | 二级 | ||
| 霸王栎 | Quercus bawanglingensis | 二级 | 其他常用中文名：坝王栎 | |
| 尖叶栎 | Quercus oxyphylla | 二级 | ||
| 胡桃科 | Juglandaceae | |||
| 喙核桃 | Annamocarya sinensis | 二级 | ||
| 贵州山核桃 | Carya kweichowensis | 二级 | ||
| 桦木科 | Betulaceae | |||
| 普陀鹅耳枥 | Carpinus putoensis | 一级 | ||
| 天台鹅耳枥 | Carpinus tientaiensis | 二级 | ||
| 天目铁木 | Ostrya rehderiana | 一级 | ||
| 葫芦科 | Cucurbitaceae | |||
| 野黄瓜* | Cucumis sativus var. xishuangbannanensis | 二级 | ||
| 四数木科 | Tetramelaceae | |||
| 四数木 | Tetrameles nudiflora | 二级 | ||
| 秋海棠科 | Begoniaceae | |||
| 蛛网脉秋海棠* | Begonia arachnoidea | 二级 | ||
| 阳春秋海棠* | Begonia coptidifolia | 二级 | ||
| 黑峰秋海棠* | Begonia ferox | 二级 | 其他常用中文名：刺秋海棠 | |
| 古林箐秋海棠* | Begonia gulinqingensis | 二级 | ||
| 古龙山秋海棠* | Begonia gulongshanensis | 二级 | ||
| 海南秋海棠* | Begonia hainanensis | 二级 | ||
| 香港秋海棠* | Begonia hongkongensis | 二级 | ||
| 卫矛科 | Celastraceae | |||
| 永瓣藤 | Monimopetalum chinense | 二级 | ||
| 斜翼 | Plagiopteron suaveolens | 二级 | ||
| 安神木科 | Centroplacaceae | |||
| 膝柄木 | Bhesa robusta | 一级 | ||
| 金莲木科 | Ochnaceae | |||
| 合柱金莲木 | SaUVagesia rhodoleuca | 二级 | ||
| 川苔草科 | Podostemaceae | |||
| 川苔草属（所有种）* | Cladopus spp. | 二级 | ||
| 川藻属（所有种）* | Dalzellia spp. | 二级 | ||
| 水石衣* | Hydrobryum griffithii | 二级 | ||
| 藤黄科 | Clusiaceae | |||
| 金丝李 | Garcinia paucinervis | 二级 | ||
| 双籽藤黄* | Garcinia tetralata | 二级 | ||
| 青钟麻科 | Achariaceae | |||
| 海南大风子 | Hydnocarpus hainanensis | 二级 | ||
| 杨柳科 | Salicaceae | |||
| 额河杨 | Populus × irtyschensis | 二级 | 发表时名称: Populus ×jrtyschensis | |
| 大花草科 | Rafflesiaceae | |||
| 寄生花 | Sapria himalayana | 二级 | ||
| 大戟科 | Euphorbiaceae | |||
| 东京桐 | Deutzianthus tonkinensis | 二级 | ||
| 使君子科 | Combretaceae | |||
| 萼翅藤 | Getonia floribunda | 一级 | ||
| 红榄李* | Lumnitzera littorea | 一级 | ||
| 千果榄仁 | Terminalia myriocarpa | 二级 | ||
| 千屈菜科 | Lythraceae | |||
| 小果紫薇 | Lagerstroemia minuticarpa | 二级 | ||
| 毛紫薇 | Lagerstroemia villosa | 二级 | ||
| 水芫花 | Pemphis acidula | 二级 | ||
| 细果野菱（野菱）* | Trapa incisa | 二级 | ||
| 野牡丹科 | Melastomataceae | |||
| 虎颜花* | Tigridiopalma magnifica | 二级 | ||
| 漆树科 | Anacardiaceae | |||
| 林生杧果 | Mangifera sylvatica | 二级 | ||
| 无患子科 | Sapindaceae | |||
| 梓叶槭 | Acer amplum subsp. catalpifolium | 二级 | ||
| 庙台槭 | Acer miaotaiense | 二级 | 羊角槭并入本种 | |
| 五小叶槭 | Acer pentaphyllum | 二级 | 其他常用中文名：五小叶枫 | |
| 漾濞槭 | Acer yangbiense | 二级 | 其他常用中文名：漾濞枫 | |
| 龙眼* | Dimocarpus longan | 二级 | ||
| 云南金钱槭 | Dipteronia dyeriana | 二级 | ||
| 伞花木 | Eurycorymbus cavaleriei | 二级 | ||
| 掌叶木 | Handeliodendron bodinieri | 二级 | ||
| 爪耳木 | Lepisanthes unilocularis | 二级 | ||
| 野生荔枝* | Litchi chinensis var. euspontanea | 二级 | Flora of China使用名称Litchi
chinensis |
|
| 韶子* | Nephelium chryseum | 二级 | ||
| 海南假韶子 | Paranephelium hainanense | 二级 | ||
| 芸香科 | Rutaceae | |||
| 宜昌橙* | Citrus cavaleriei | 二级 | 其他常用学名：Citrus ichangensis | |
| 道县野桔* | Citrus daoxianensis | 二级 | Flora of China 使 用 名 称： 柑橘
Citrus reticulata |
|
| 红河橙* | Citrus hongheensis | 二级 | Flora of China使用名称：宜昌橙
Citrus cavaleriei |
|
| 莽山野桔* | Citrus mangshanensis | 二级 | Flora of China使用名称：柑橘
Citrus reticulata |
|
| 山橘* | Fortunella hindsii | 二级 | Flora of China使用名称：金柑
Citrus japonica |
|
| 金豆* | Fortunella venosa | 二级 | Flora of China使用名称：金柑
Citrus japonica |
|
| 黄檗 | Phellodendron amurense | 二级 | 其他常用中文名：黄波椤 | |
| 川黄檗 | Phellodendron chinense | 二级 | ||
| 富民枳* | Poncirus × polyandra | 二级 | Flora of China使用名称Citrus ×
polytrifolia |
|
| 楝科 | Meliaceae | |||
| 望谟崖摩 | Aglaia lawii | 二级 | ||
| 红椿 | Toona ciliata | 二级 | 毛红椿并入本种 | |
| 木果楝 | Xylocarpus granatum | 二级 | ||
| 锦葵科 | Malvaceae | |||
| 柄翅果 | Burretiodendron esquirolii | 二级 | ||
| 滇桐 | Craigia yunnanensis | 二级 | ||
| 海南椴 | Diplodiscus trichospermus | 二级 | ||
| 蚬木 | Excentrodendron tonkinense | 二级 | ||
| 广西火桐 | Erythropsis kwangsiensis | 一级 | 其他常用学名：Firmiana
kwangsiensis |
|
| 梧桐属（所有种，梧桐除外） | Firmiana spp. (excl. F. simplex ) | 二级 | ||
| 蝴蝶树 | Heritiera parvifolia | 二级 | ||
| 平当树 | Paradombeya sinensis | 二级 | ||
| 景东翅子树 | Pterospermum kingtungense | 二级 | ||
| 勐仑翅子树 | Pterospermum menglunense | 二级 | ||
| 粗齿梭罗 | Reevesia rotundifolia | 二级 | ||
| 紫椴 | Tilia amurensis | 二级 | ||
| 瑞香科 | Thymelaeaceae | |||
| 土沉香 | Aquilaria sinensis | 二级 | ||
| 云南沉香 | Aquilaria yunnanensis | 二级 | ||
| 半日花科 | Cistaceae | |||
| 半日花* | Helianthemum songaricum | 二级 | ||
| 龙脑香科 | Dipterocarpaceae | |||
| 东京龙脑香 | Dipterocarpus retusus | 一级 | ||
| 狭叶坡垒 | Hopea chinensis | 二级 | 多毛坡垒并入本种 | |
| 坡垒 | Hopea hainanensis | 一级 | ||
| 翼坡垒(铁凌) | Hopea reticulata | 二级 | ||
| 西藏坡垒 | Hopea shingkeng | 二级 | ||
| 望天树 | Parashorea chinensis | 一级 | ||
| 云南娑罗双 | Shorea assamica | 一级 | ||
| 广西青梅 | Vatica guangxiensis | 一级 | ||
| 青梅 | Vatica mangachapoi | 二级 | ||
| 叠珠树科 | Akaniaceae | |||
| 伯乐树（钟萼木） | Bretschneidera sinensis | 二级 | ||
| 铁青树科 | Olacaceae | |||
| 蒜头果 | Malania oleifera | 二级 | ||
| 瓣鳞花科 | Frankeniaceae | |||
| 瓣鳞花 | Frankenia pulverulenta | 二级 | ||
| 柽柳科 | Tamaricaceae | |||
| 疏花水柏枝 | Myricaria laxiflora | 二级 | ||
| 蓼科 | Polygonaceae | |||
| 金荞麦* | Fagopyrum dibotrys | 二级 | 其他常用中文名：金荞 | |
| 茅膏菜科 | Droseraceae | |||
| 貉藻* | Aldrovanda vesiculosa | 一级 | ||
| 石竹科 | Caryophyllaceae | |||
| 金铁锁 | Psammosilene tunicoides | 二级 | ||
| 苋科 | Amaranthaceae | |||
| 苞藜* | Baolia bracteata | 二级 | ||
| 阿拉善单刺蓬* | Cornulaca alaschanica | 二级 | ||
| 蓝果树科 | Nyssaceae | |||
| 珙桐 | Davidia involucrata | 一级 | 含种下等级，光叶珙桐并入本种 | |
| 云南蓝果树 | Nyssa yunnanensis | 一级 | ||
| 绣球花科 | Hydrangeaceae | |||
| 黄山梅 | Kirengeshoma palmata | 二级 | ||
| 蛛网萼 | Platycrater arguta | 二级 | ||
| 五列木科 | Pentaphylacaceae | |||
| 猪血木 | Euryodendron excelsum | 一级 | ||
| 山榄科 | Sapotaceae | |||
| 滇藏榄 | Diploknema yunnanensis | 一级 | 其他常用中文名：云南藏榄 | |
| 海南紫荆木 | Madhuca hainanensis | 二级 | ||
| 紫荆木 | Madhuca pasquieri | 二级 | ||
| 柿树科 | Ebenaceae | |||
| 小萼柿* | Diospyros minutisepala | 二级 | ||
| 川柿* | Diospyros sutchuensis | 二级 | ||
| 报春花科 | Primulaceae | |||
| 羽叶点地梅* | Pomatosace filicula | 二级 | ||
| 山茶科 | Theaceae | |||
| 圆籽荷 | Apterosperma oblata | 二级 | ||
| 杜鹃红山茶 | Camellia azalea | 一级 | 其他常用中文名：杜鹃叶山茶 | |
| 山茶属金花茶组（所有种） | Camellia sect. Chrysantha spp. | 二级 | ||
| 山茶属茶组（所有种, 大叶茶、大理茶除外）* | Camellia sect. Thea spp. (excl. C. sinensis
var. assamica, C. taliensis ) |
二级 | ||
| 大叶茶 | Camellia sinensis var. assamica | 二级 | 其他常用中文名：普洱茶 | |
| 大理茶 | Camellia taliensis | 二级 | ||
| 安息香科 | Styracaceae | |||
| 秤锤树属（所有种） | Sinojackia spp. | 二级 | ||
| 猕猴桃科 | Actinidiaceae | |||
| 软枣猕猴桃* | Actinidia arguta | 二级 | ||
| 中华猕猴桃* | Actinidia chinensis | 二级 | ||
| 金花猕猴桃* | Actinidia chrysantha | 二级 | ||
| 条叶猕猴桃* | Actinidia fortunatii | 二级 | ||
| 大籽猕猴桃* | Actinidia macrosperma | 二级 | ||
| 杜鹃花科 | Ericaceae | |||
| 兴安杜鹃 | Rhododendron dauricum | 二级 | ||
| 朱红大杜鹃 | Rhododendron griersonianum | 二级 | ||
| 华顶杜鹃 | Rhododendron huadingense | 二级 | ||
| 井冈山杜鹃 | Rhododendron jingangshanicum | 二级 | ||
| 江西杜鹃 | Rhododendron kiangsiense | 二级 | ||
| 尾叶杜鹃 | Rhododendron urophyllum | 二级 | ||
| 圆叶杜鹃 | Rhododendron williamsianum | 二级 | ||
| 茜草科 | Rubiaceae | |||
| 绣球茜 | Dunnia sinensis | 二级 | ||
| 香果树 | Emmenopterys henryi | 二级 | ||
| 巴戟天 | Morinda officinalis | 二级 | ||
| 滇南新乌檀 | Neonauclea tsaiana | 二级 | ||
| 龙胆科 | Gentianaceae | |||
| 辐花 | Lomatogoniopsis alpina | 二级 | ||
| 夹竹桃科 | Apocynaceae | |||
| 驼峰藤 | Merrillanthus hainanensis | 二级 | ||
| 富宁藤 | Parepigynum funingense | 二级 | ||
| 紫草科 | Boraginaceae | |||
| 新疆紫草* | Arnebia euchroma | 二级 | 其他常用中文名：软紫草 | |
| 橙花破布木 | Cordia subcordata | 二级 | ||
| 茄科 | Solanaceae | |||
| 黑果枸杞* | Lycium ruthenicum | 二级 | ||
| 云南枸杞* | Lycium yunnanense | 二级 | ||
| 木犀科 | Oleaceae | |||
| 水曲柳 | Fraxinus mandschurica | 二级 | 其他常用学名：Fraxinus
mandshurica |
|
| 天山梣 | Fraxinus sogdiana | 二级 | ||
| 毛柄木犀 | Osmanthus pubipedicellatus | 二级 | ||
| 毛木犀 | Osmanthus venosus | 二级 | ||
| 苦苣苔科 | Gesneriaceae | |||
| 瑶山苣苔 | Dayaoshania cotinifolia | 二级 | ||
| 秦岭石蝴蝶 | Petrocosmea qinlingensis | 二级 | ||
| 报春苣苔 | Primulina tabacum | 二级 | ||
| 辐花苣苔 | Thamnocharis esquirolii | 一级 | ||
| 车前科 | Plantaginaceae | |||
| 胡黄连 | Neopicrorhiza scrophulariiflora | 二级 | ||
| 丰都车前* | Plantago fengdouensis | 二级 | ||
| 玄参科 | Scrophulariaceae | |||
| 长柱玄参* | Scrophularia stylosa | 二级 | ||
| 狸藻科 | Lentibulariaceae | |||
| 盾鳞狸藻* | Utricularia punctata | 二级 | ||
| 唇形科 | Lamiaceae | |||
| 苦梓 | Gmelina hainanensis | 二级 | 其他常用中文名：海南石梓 | |
| 保亭花 | Wenchengia alternifolia | 二级 | ||
| 列当科 | Orobanchaceae | |||
| 草苁蓉* | Boschniakia rossica | 二级 | ||
| 肉苁蓉* | Cistanche deserticola | 二级 | ||
| 管花肉苁蓉* | Cistanche mongolica | 二级 | 其他常用学名：Cistanche tubulosa | |
| 崖白菜 | Triaenophora rupestris | 二级 | 其他常用中文名：呆白菜 | |
| 冬青科 | Aquifoliaceae | |||
| 扣树 | Ilex kaushue | 二级 | ||
| 桔梗科 | Campanulaceae | |||
| 刺萼参* | Echinocodon draco | 二级 | ||
| 菊科 | Asteraceae | |||
| 白菊木 | Leucomeris decora | 二级 | ||
| 巴朗山雪莲 | Saussurea balangshanensis | 二级 | ||
| 雪兔子 | Saussurea gossipiphora | 二级 | ||
| 雪莲 | Saussurea involucrata | 二级 | 其他常用中文名：雪莲花 | |
| 绵头雪兔子 | Saussurea laniceps | 二级 | ||
| 水母雪兔子 | Saussurea medusa | 二级 | ||
| 阿尔泰雪莲 | Saussurea orgaadayi | 二级 | ||
| 革苞菊 | Tugarinovia mongolica | 二级 | ||
| 忍冬科 | Caprifoliaceae | |||
| 七子花 | Heptacodium miconioides | 二级 | ||
| 丁香叶忍冬 | Lonicera oblata | 二级 | ||
| 匙叶甘松 |
Nardostachys jatamansi |
二级 | 其他常用中文名：甘松;
其他常用学名：Nardostachys chinensis, N. grandiflora |
|
| 五加科 | Araliaceae | |||
| 人参属（所有种）* | Panax spp. | 二级 | ||
| 华参* | Sinopanax formosanus | 二级 | ||
| 伞形科 | Apiaceae | |||
| 山茴香* | Carlesia sinensis | 二级 | ||
| 明党参* | Changium smyrnioides | 二级 | ||
| 川明参* | Chuanminshen violaceum | 二级 | ||
| 阜康阿魏* | Ferula fukanensis | 二级 | ||
| 麝香阿魏* | Ferula moschata | 二级 | ||
| 新疆阿魏* | Ferula sinkiangensis | 二级 | ||
| 珊瑚菜（北沙参）* | Glehnia littoralis | 二级 | ||
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